農作物種子是農業高新技術的載體，做好種子的安全貯藏是實現種子商品價值和使用價值的基礎。因此，種子冬春貯藏期間，應加強倉庫管理，防止種子變質和損壞，確保種子安全貯藏。
　　
　　 一、控制濕度種子含水量大小，是種子能否貯藏、能否延長使用壽命的重要因素。剛收獲的種子，一般含水量偏高，呼吸作用旺盛，容易產生大量呼吸熱和水分，易招致細菌、霉菌的侵染和繁殖，使種子胚部遭到破壞，降低種子發芽率；同時還加速了種子養分的消耗，使種子抗逆性和生活力降低，影響種子的內在質量。為了使種子含水量達到安全貯藏標準，種子入庫前，應選擇晴天反復晾曬或使用機械烘干，強制種子中的水分降至安全貯藏水平之下。不同作物種子安全含水量標準不同：小麥、谷子為13%，玉米、高粱為14%，水稻為15%，棉籽為11%，花生為9%，大豆、向日葵為12%，西紅柿為7%～12%，菜豆為10%～12%，茄子、白菜為7%～11%，煙草種子為8%。
　　
　　 二、種子包衣種子包衣是指在種子外面包上一層含有殺蟲劑、殺菌劑、復合肥料、微量元素、植物生長調節劑、緩釋劑和成膜劑的外衣，這層外衣成為種衣劑，它是一種新型的藥肥農產品，具有殺滅種子內外寄藏病菌、地下害蟲和防治苗期病蟲害，促進苗壯、苗齊、苗全的作用。使用合格的種衣劑（如適樂時、敵萎丹、滿適金、帥苗、銳勝、金阿普隆、立克秀、衛福等）包衣，可減少農藥的使用量，減輕農藥對環境的污染，從源頭上控制種傳和土傳病蟲危害，防效可達40～120天，一般可增產10%左右。種子除人工包衣外，主要使用種子包衣機進行包衣，種子包衣過程中要嚴格按藥種比進行，以免產生藥害或達不到藥效。經過包衣的種子適當晾曬后，即可裝袋貯存。
　　
　　 三、科學貯藏種子經過晾曬、精選加工和包衣處理后，可按規格、等級裝入編織袋、麻袋或布袋中；對于量小的蔬菜種子，可裝入真空鋁箔袋、罐頭盒內，真空包裝是目前比較先進的貯藏方法。
　　
　　 有條件的地方，可使用干燥貯藏庫（只調節濕度）、冷卻除濕庫（能調節溫度、濕度）、低溫干燥庫（溫度在0℃以下、空氣相對濕度在30%左右）貯存種子，效果更好。
　　
　　 另外，嚴禁使用塑料袋裝種子；不要將種子與農藥、化肥混放在一起；要遠離火源，防止熱氣和煙氣熏蒸；在室外存放的種子，要防止被雨雪淋濕，杜絕影響種子貯藏質量的現象發生。同時要定期檢查種子的發芽率和發芽勢，采取必要的管理措施，確保種子冬春安全貯存。